文章摘要:目的:鉴定药用大黄（Rheum officinale）黑粉病病原菌,分析比较染病和健康药用大黄内生真菌群落结构。方法:通过田间调查,并经形态学和系统发育树分析鉴定致病菌。采用高通量测序技术分析比较感染黑粉病和健康药用大黄植株内生真菌的群落结构。结果:恩施州药用大黄产区黑粉病感染十分严重,田间感染率在80%左右,严重地块死亡率30%左右;经鉴定其致病菌为Thecaphora schwarzmaniana。染病药用大黄植株内生真菌群落α多样性指数Simpson、Chao1、ACE、Shannon均显著下降,丰富度和多样性均显著低于健康药用大黄植株内生真菌群落。健康药用大黄植株内生真菌优势菌属为10.75%Naganishia、9.33%小双胞腔菌属（Didymella）、9.14%曲霉属（Aspergillus）、7.72%链格孢属（Alternaria）、4.66%马拉色菌属（Malassezia）、3.09%枝孢霉属（Cladosporium）、2.73%Cutaneotrichosporon;染病药用大黄植株内生真菌优势菌属为45.75%楔孢黑粉菌属（Thecaphora）、38.23%赤霉菌属（Gibberella）、6.74%链格孢属（Alternaria）、2.27%镰孢霉属（Fusarium）、1.78%小双胞腔菌属（Didymella）、1.16%Vishniacozyma。结论:该结果对于识别药用大黄黑粉病及进一步研究黑粉病发生的微生态机制和生物防治具有一定的理论指导意义。

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